El término de bioquímica reúne en su nombre dos ramas del saber que tradicionalmente se habían tomado por separado. Pero esta distinción respondía en esencia a un recurso metodológico que se siguió con el nacimiento de la ciencia para comprender los procesos naturales. Era un recurso en los que los primeros pasos de la ciencia permitía conocer a las substancias inertes de manera separada de las que contenían vida.
En el mundo que ahora vivimos, la visión que rodea a los seres humanos ha cambiado. Ni las sustancias en estado mas puro, ahora se sabe que están precisamente inertes, ni los seres vivos son ajenos a todos los demás elementos que los rodean. Si bien, por razones metodológicas y en la búsqueda de una mejor comprensión de las cosas es conveniente separar los procesos, en la cada real, en la hechos, hay una constante interacción entre ellos. De esta manera, cuando hablamos de bioquímica se realizar el estudio de la interacción de dos disciplinas del conocimiento: la biología y la química, en una preocupación enfocada a la comprensión de la vida, es decir, la de los procesos químicos esenciales para la vida, tales como: el agua, los aminoácidos, las proteínas, los lípidos, los péptidos, las enzimas, los carbohidratos, los ácidos nucleicos (ADN y ARN).
Pero el estudio de la interacción de diferentes procesos no se agota en dos, sino la pretensión de mayor conocimiento plantea retos mas grandes. Según Mc Kee, James y Mc Kee T. (2003) “los bioquímicos han investigado los seres vivos con un enfoque experimental único que se basa en los conceptos de la biología, la química, la física y las matemáticas”. Aun mas, el estudio del metabolismo aborda el campo de la Bioquímica enfocado al estudio de las diversas reacciones químicas que experimentan, por ejemplo, los alimentos en el cuerpo humano para proporcionar energía y los componentes químicos fundamentales de la vida. Este campo esta relacionado con temas de la Estequiometria, Termodinámica y de la Cinética Química.
En lo que se refiere a la formulación de las distintas sustancias esenciales para la vida, la Estequiometria aporta las bases para el calculo de las cantidades de sustancias a reaccionar o a producirse en un proceso metabólico, por ejemplo, el de respiración, en el cual se libera energía. Es estos términos, el tema de Cinética química estudia las velocidades, energías de activación y mecanismos de cada reacción metabólica.
Las sustancias en el organismo reaccionan con el oxigeno que respiramos. Los que se denominan reacciones de combustión, donde se produce bióxido de carbono, vapor de agua y energía, se les llama exotérmicas.
La estequiometria se ocupa del balanceo de ecuaciones que representan todas las reacciones químicas, incluidas las de combustión que se pueden llevar a cabo dentro de organismos vivos así como en el medio ambiente. Como ejemplo podríamos plantear la ecuación en que reacciona el metano con oxigeno (el compuesto orgánico mas simple es el hidruro de metano, gas que se produce de la descomposición de la materia orgánica):
Del mismo modo, podemos plantear la ecuación de la reacción del propano (gas domestico) con oxigeno:
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